Jardel começou sua carreira no Ferroviário do Ceará, onde chamou a atenção do Vasco, clube que o contratou. Ganhou vários títulos pela categoria de base do Vasco, bem como dois títulos cariocas como profissional em 1993 e 1994. Por tais feitos, despertou o interesse do Grêmio, que o contratou por empréstimo em 1995.
No mesmo ano o Porto buscou junto ao Vasco sua contratação por US$ 1.500.000,00, mas em respeito a um acordo firmado entre Eurico Miranda, presidente do Vasco, e Fábio Koff, presidente do Grêmio, a equipe cruzmaltina manteve a palavra, garantindo a venda do jogador por US$ 1.000.000,00 para o Tricolor Gaúcho [1]. Poucos dias antes da final do Mundial a venda de Jardel foi sacramentada ao Rangers da Escócia por US$ 4.500.000,00, como não obteve o passaporte europeu, os empresários alugaram seu passe ao Grêmio, Jardel permaneceu e levou o Imortal à conquista da Recopa Sul-Americana e ao bicampeonato gaúcho com duas atuações de gala frente ao Juventude na sua despedida.
Na Europa
A equipe do Porto não desistiu da contratação e acabou adquirindo Jardel em 1996. Atuando em Portugal manteve seu nível de grande goleador quando foi o principal artilheiro da Europa nos anos de 1997 e 1999, ganhando a Chuteira de Ouro e a de bronze em 2000. No campeonato português foi artilheiro por quatros vezes em 1996/97 (30 gols), 1997/98 (26 gols), 1998/99 (36 gols) e 1999/00 (38 gols). Ainda pelo Porto foi tri-campeão português de 1996/97,1997/98 e 1998/99 e bi-campeão da Taça de Portugal em 1997/98 e 1999/00. Ainda conquistou a Supertaça de Portugal de 1996/97.
Na temporada 2000/2001 foi transferido para o Galatasaray da Turquia onde foi vice-campeão turco e campeão da Supercopa da UEFA de 2000 batendo o poderoso Real Madrid de Casillas, Roberto Carlos, Figo e Raúl pelo placar de 2x1, com dois gols de Jardel.
Sua passagem pelo futebol turco foi curta e em 2001 regressou para Portugal, mas desta vez jogando pelo Sporting. Manteve seu grande nível tornando-se campeão português em 2001/02 e artilheiro com 42 gols. Na mesma temporada foi campeão da Taça de Portugal marcando o gol na finalíssima.
Outros clubes
A partir de 2003 seu futebol não se desenvolveu de forma plena, passando por diversos clubes sem repetir o mesmo sucesso. Teve passagens pelo futebol inglês, italiano, espanhol, argentino, português, cipriota e australiano. Retornou ao Brasil para o Palmeiras onde apenas treinou e ainda atuou com as camisas do Goiás, Criciúma, Flamengo do Piauí, Ferroviário e América, ambos do Ceará.
Seleção Brasileira
Jardel participou do Mundial Sub-20 na Austrália com a Seleção Brasileira, e sagrou-se campeão. Em 2001 estava na equipe principal que disputou a Copa América.
Aposentadoria
Após uma breve passagem pelo futebol búlgaro em 2010, foi apresentado pelo Rio Negro do Amazonas, onde não chegou a disputar uma partida, encerrando de forma definitiva sua carreira como jogador de futebol.